Ders Tanımları
CHBI 406
Biyoenformatik temellerine giriş, biyolojik problemlerin hesaplamalı problemler olarak tanımlanması, sekans verisi-veri tabanları ve literatür bilgilerine programlamalı erişim, dinamik programlama ve sekans hizalama algoritmaları, çoklu sekans hizalama algoritmaları, ileri veri tabanı arama ve BLAST algoritmik detayları, saklı Markov modellerine giriş, protein/DNA sekanslarında motif ve örüntü bulma algoritmaları, genom birleştirme ve dizi yeniden yapılandırma algoritmaları, ağaç yapılandırma algoritmaları, biyolojik ağlar, yapısal biyoenformatiğe giriş, doğadaki algoritmalar (mantar ağı, bakteri kemotaksisi)
CHBI 503
Klasik termodinamik, entalpi, entropi, serbest enerji, denge konumlari, istatistik termodinamige giris, malzemele ozelliklerinin tanimlanmasi. Kinetik surecler. Isi, kutle ve enerji difuzyonu. Dinamik surecler ve donusumler.
CHBI 506
Biyoenformatik temellerine giriş, biyolojik problemlerin hesaplamalı problemler olarak tanımlanması, sekans verisi-veri tabanları ve literatür bilgilerine programlamalı erişim, dinamik programlama ve sekans hizalama algoritmaları, çoklu sekans hizalama algoritmaları, ileri veri tabanı arama ve BLAST algoritmik detayları, saklı Markov modellerine giriş, protein/DNA sekanslarında motif ve örüntü bulma algoritmaları, genom birleştirme ve dizi yeniden yapılandırma algoritmaları, ağaç yapılandırma algoritmaları, biyolojik ağlar, yapısal biyoenformatiğe giriş, doğadaki algoritmalar (mantar ağı, bakteri kemotaksisi)
CHBI 510
Mikrobiyal fizyolojiye giriş; mikroorganizmalarda metabolik yolaklar ve ürünler; Endüstride kullanılan mikroorganizmalar; Endüstriyel düzeyde mikroorganizma büyütme teknikleri
CHBI 515
Ham petrolün ve biokütlenin rafineri işlemleri; ham petrol için distilasyon, katalitik ve termal kırma, yakıt iyileştirme ve diğer yan ürün işlemleri, biokütle için gazlaştırma, piroliz, transesterleştirme, yoğunlaştırma işlemleri; rafineri işlemleri için ekonomik ve çevresel etkenler.
CHBI 502
CHBI 505
Kuçük moleküllerle polimerlerin farklılıkları, termosetler, termoplastlar, moleküler yapı ve özellikler arasındaki ilişkiler, belli başlı polimerler, çok moleküllü yapılar, kompozıtler, kopolimerler.
CHBI 509
CHBI 512
Yüzeye adzorpsiyon, adzorpsiyonda yapısal ve dinamik süreçler, adzorpsiyon termodinamiği, katalizör karakterizasyon metotları, gözenek yapıları ve yüzey alanı, kataliz için yüzey kimyası, metaller, çok iyi dağılmış katalizörler, enerji üretimi ağırlıklı endüstriyel örnekler
CHBI 517
İlaç tasarımı, hastalığa neden olan bir hedefin (DNA, RNA, proteinler) aktivitesini durdurmak için belirli bir bölgeye yapışacak uygun bir ilaç molekülü oluşturma yöntemidir. Bu derste, böyle bir molekülün bilgisayar ortamında elde edilişi ele alınacaktır. İşlenecek konular: Hedef üzerindeki aktif bölgenin tayini. İlaç-reseptör etkileşmelerini kontrol eden kuvvetler. İlaç kütüphanelerinin taranması yöntemleri. İlaç yapışma enerjilerinin tayini için değişik yazılımların kullanılması. Kılavuz molekülün elde edilmesi ve geliştirilmesi. Başarılı ve başarısız olmuş ilaçların incelenmesi.
CHBI 501
Akışkanlar mekaniği; momentum transferi ve hız dağılımları; sabit sıcaklıktaki sistemlerde enerji ve kütle transferi; sıcaklık ve konsantrasyon dağılımları; kimyasal tepkimeler içeren kütle transferi; kimyasal ve biyolojik sistemlere uygulamaları.
CHBI 504
CHBI 507
CHBI 511
Enerji üretim tekniklerinin incelenmesi; günümüzde kullanılan enerjilerin çevre ve ekonomiye olan etkileri; Su gücü, rüzgar enerjisi, dalga enerjisi, gelgit enerjisi, okyanus ısıl enerjisi, jeotermal enerji, biyokütle enerjisi, enerji depolama. Enerji üretim sistemlerinin günümüzde sürdürülebilir olması anlamında incelemeler.
CHBI 516
Rekombinant DNA teknolojisi; enzimler ve biyomoleküller; moleküler genetik; mikroorganizmaların ticari kullanım alanları; biyoayrışma teknikleri; transgenik teknolojisi; Gen terapisi; Biyoyoteknolojinin çevre, tarım ve ilaç sektöründe uygulamaları
